Система циатокотилят Дюбуа имеет ряд положительных черт по сравнению с системой, предложенной Сцидатом. В ней исправлена ошибка последнего автора, и подсемейство Pharyngostominae с родом Pharyngostomum выведено из состава надсемейства.
Для паразитов рептилий Дюбуа обосновал новый род Szidatia, который вместе с уже известным родом Gogatea объединил в новое подсемейство Szidatinae. Обоснование нового подсемейства оправдывается тем, что оба рода включают в себя наиболее примитивные формы циатокотилид. Для каждого из этих родов автор обосновал подподсемейство. Дюбуа ликвидировал род Paracyathocotyle, описанный Сцидатом. Род был обоснован для форм с признаками рода Cyathocotyle, но лишенных брюшной присоски. Однако Дюбуа обнаружил брюшную присоску у типичного вида и показал несостоятельность этого признака.
Система Сцидата и Дюбуа составила основу современной структуры подотряда Cyathocotylata. В дальнейшем неоднократно вносились изменения в классификацию циатокотилят, точнее, семейства Cyathocotylidae. Наиболее значительные из них приведены в работах Дюбуа (Dubois, 1944, 1951, 1953), Мэра (Mehra, 1943, 1947), Ямагути (Yamaguti, 1958).
В работе 1944 г. Дюбуа внес лишь незначительные изменения в систему 1938 г. Он признал несостоятельным род Cyathocotyloides и перевел его в синонимы рода Holostephanus. Мысль об идентичности родов была первоначально высказана в 1939 г. Ямагути. В числе видов p. Cyathocotyle он включил С. lutzi и С. bambusicolae, описанные Фаустом и Тангом (Faust el Tang, 1938) как виды рода Linstowiella. Теми же авторами были описаны Prosostephanus parvoviparus n. sp. и Travassosella pagumae n. gen., n. sp. Оба вида Дюбуа поместил в род Prosostephanus, переведя в его синонимы род Travassosella.