Желточники либо в виде тонких извитых трубок, либо древовидно-разветвленные.
Желточники древовидно-разветвленные, расположены в задней части тела, заканчиваясь почти на одном уровне со слепыми концами кишечных стволов. Яичник трубчатый, изогнутый, лежит позади семенников в задней половине тела. Семенники расположены симметрично, непосредственно позади брюшной присоски. Имеется гермафродитная бурса, у основания которой семяизвергательный канал соединяется с метратермом, образуя гермафродитный проток. Паразиты плавательного пузыря рыб - Isoparorchidae Poche, 1925.
Желточники состоят из сплетения тонких извитых трубок.
Помимо гермафродитной бурсы, у основания которой лежат семяизвергательный сосочек и дистальный конец метратерма, имеется крупная специализированная семяизвергательная бурса, содержащая длинный мышечный закрученный семяизвергательный проток, выступающий в виде сосочка в гермафродитную бурсу. Парпые желточники узкие, трубчатые, располагаются латерально в задней половине тела - Lampritrematidae Skrjabin et Guschanskaja, 1954.
Семяизвергательная бурса отсутствует.
Терминальный участок полового аппарата состоит из гермафродитной бурсы, окружающей гермафродитный проток. От последнего отходят простатическая часть и матратерм. Семенника два. Желточники парные, состоят из длинных тонких извитых трубок, лежащих либо медианно, либо латерально. Экскреторный аппарат простой, Y-образный, без лакунарной системы. Трематоды удлиненной формы в основном с хвостовым придатком (исключение Prosorchinae) - Dinuridae Skrjabin et Guschanskaja, 1954.
Терминальный участок полового аппарата простой. Имеется гермафродитный проток, либо заключенный в гермафродитную бурсу, либо он лежит свободно в паренхиме, когда бурса отсутствует. Желточники состоят из длинных густо сплетенных трубок, лежащих вентрально, интерцекально. Экскреторный аппарат сложного строения, снабжен лакунарной системой. Трематоды удлиненноовальной формы, без хвостового придатка - Sclerodistomatidac Dollfus, 1932.
Считаем целесообразным привести схемы систем семейств, входящих в подотряд Hemiurata (Markevitsch, 1951) Skrjabin et Guschanskaja, 1954.