Яичник один. Форма яичника обычно овальная, цельнокрайная, в виде исключения лопастная (роды: Macradenina, Тrifoliovarium, Lecithaster), трубчатая (семейство Isoparorchidae) или гроздевидная из отдельных фолликулов (семейство Syncoeliidae).
Локализуется яичник преимущественно позади семенников более или менее медианно или медиально.
У представителей семейств Ptychogonimidae и Haplosplanchnidae, а также подсемейства Gonocercinae из семейства Halipegidae яичник находится впереди семенников, у сем. Bathycotylidae — между семенниками.
От яичника отходит яйцевод, соединяющийся с лауреровым каналом (когда он имеется), затем с общим желточным протоком, дальше переходит в оотип, который в свою очередь окружен тельцем Мелиса. Семяприемник имеется или отсутствует. Иногда вместо настоящего семяприемника имеется маточный семяприемник.
Строение терминального участка полового аппарата с гермафродитной бурсой.
а — Lecithochirium floridense (Manter, 1934); б — Separogermiductus inimici (Yamaguti, 1934); в—Dissosaccus laevis (Linton, 1898); г — Ceratotrema furcolabiata I. Jones, 1933. Обозначения: acet.— брюшная присоска; с — кишечник; b.h.— гермафродитная бурса; g.p.— половое отверстие; d.h. гермафродитный проток; metr.— метратерм; p.p.— простатическая часть; v.pr.— простатический пузырек; v.s.— семенной пузырек.
Строение терминального участка полового аппарата с гермафродитной бурсой
а — Mecoderus oligoplitis Manter, 1940; б — Pseudo stomachicola rubea (Linton, 1910); в — Uterovesiculurus hamati (Yamaguti, 1934). Обозначения: acet.— брюшная присоска; b.h. — гермафродитная бурса; d.h.— гермафродитный проток; metr.— метра-терм, p.p.— простатическая часть; g.p. половое отверстие; ut. — матка; v.d.—vas deferens; v.u.— маточный пузырек (vesicula uterina); v.s.— семенной пузырек.