У метацеркариев первичная экскреторная система изучена еще слабо. Сильное развитие каналов вторичной экскреторной системы, наполненных известковыми тельцами и жировыми каплями, маскируют элементы первичной системы и затрудняют их исследование.
Ее удается обычно проследить на молодых личинках, когда сеть каналов вторичной системы еще не достигла расцвета. Первичная экскреторная система метацеркариев построена по тому же плану, что и у церкариев, и отличается большим развитием более мелких ответвлений сосудов, числом терминальных клеток в каждой группе и общим числом последних, которое может быть значительным. Так, по данным Фауста (1921), у Tetracotyle orientalis (Faust, 1921) число пламеневидных клеток достигает 640. Большое количество этих клеток имеют метацеркарий Diplostomum spathaceum и Tetracotyle typica (Комия, 1938).
Первичная экскреторная система половозрелых стригеидид остается неисследованной. Долгое время не был установлен даже сам факт наличия ее у марит. Имеется указание Комия (1938) о том, что у половозрелой трематоды Paracoenogonimus ovalus (подотряд Cyathocotylata) первичная экскреторная система имеет формулу: 2х {[(3 + 3 + 3) + [(1 + 1 + 3) + + (4 + 3 + 4)]}, т. е. напоминает систему метацеркария этой трематоды.
Вторичная экскреторная система возникает у церкариев в виде дивертикулов на вершине первичной петли сосудов или на нисходящей латеральной ветви этой петли. Но у церкариев и мезоцеркариев эта система не получает развития. Ее расцвет связан со стадией метацеркария. У личинок этой стадии сеть каналов достигает наибольшей сложности. К настоящему времени развитие этой системы прослежено у некоторых стригеид, диплостоматид и циатокотилид, т. е. у представителей главнейших семейств отряда.