Нервная система состоит из двух ганглиев, соединенных комиссурами, расположенными позади фаринкса, и нескольких утолщенных нервных стволов, направляющихся как к переднему, так и к заднему концам тела.
По всей длине тела тянется скрученная, длинная и широкая матка, заполненная желтого цвета яйцами. Между петлями матки располагается трубчатый яичник, а также трубчатый желточник коричневого цвета.
На уровне соединения передней и средней трети длины тела располагаются грушевидный семяприемник и объемистое тельце Мелиса. Кпереди от этого места располагается яичник, а кзади — желточник.
Половое отверстие располагается непосредственно позади ротовой присоски. Лаурерова канала нет.
Семенники трубчатые, сильно извитые, располагаются в задней части тела. Они переходят в резко изогнутый vas deferens, направляющийся к половому отверстию. Дистальный конец vas deferens имеет бульбусовидное расширение, которое затем суживается и переходит в грушевидный мешок, соприкасающийся с половым отверстием.
Несмотря на то, что у обоих заключенных в цисту трематод имелась гермафродитная половая система, все же у одного экземпляра превалировали мужские элементы, а у другого — женские. По-видимому, одна особь играет роль самца, а другая — самки.
Яйца очень многочисленны, достигают 0,01 мм длины. Наружные стенки цисты, в которой локализируются эти трематоды, образованы из густой фиброзной ткани, внутри которой развивается слой, характеризующийся обильной васкуляризацией. Этот слой состоит из многочисленных пластинок и отростков, обильно орошаемых кровью, что создает благоприятные условия для питания паразитов.
Nematobothrium (Nematobothrium) sabae Ishii, 1935 (по Ишии, 1935)
a — циста на шабрах; б — головной конец; в — марита