Относительное расположение семенников и яичника приняты Стоссичем в качестве диагностических признаков при обосновании родов.
Однако Коссак и Харра считают, что вариации в расположении семенников не могут иметь большого значения в специфическом диагнозе, так как они зависят в значительной степени от развития матки и количества ее петель.
При постепенном заполнении матки яйцами семенники более или менее сближаются. Харра, на основании изучения американского материала приходит к заключению, что количество петель матки, расположенных между семенниками, варьирует от полного отсутствия их (когда семенники лежат плотно) до девяти петель, причем это количество не зависит от их общего числа. Только положение яичника является более или менее константным: он может находиться перед передним семенником, рядом с ним или позади него. Семевыносящие сосуды, отделяясь от семенников, соединяются на коротком расстоянии перед передним семенником.
Яичник цельнокрайный, сферический и соединяется с тельцем Мелиса коротким протоком. Относительно наличия семеприемника мнения исследователей расходятся. Коссак, Браун, Кон и некоторые другие указывают, что семеприемник и лауреров канал отсутствуют. Харра (1922), Нобль (1933), Ямагути (1933) и другие отмечают, что семеприемник имеется.
Харра указывает, что при исследовании большого количества экземпляров, принадлежащих к нескольким родам этого семейства, он обнаружил у них семеприемник. По описанию Харра, на одном уровне с семеприемником, дорзально от него, располагается скорлуповая железа, по размерам равная яичнику. Она состоит из плотно расположенных желез, которые выделяют свой секрет в оотип посредством короткого канальца. Эти протоки образуют внутреннюю часть железы. От оотипа отходит матка, расширяющаяся в крупный receptaculum seminis uterinum, причем этот орган во время полового созревания заполнен сперматозоидами.
Матка у представителей рода Cyclocoelum короткая и образует петли, не простирающиеся за наружные края кишечных ветвей, за исключением ряда видов, у которых петли матки доходят до наружных стенок тела. В других случаях, например у представителей рода Нaematorephus и Hyptiasmus, диаметр ветвей матки незначителен, но они переходят за ветви кишечника к краям тела и у его заднего конца они иногда сливаются, совершенно заполняя его. Отдельные петли матки у большинства лежат, плотно соприкасаясь одна с другой; только у представителей рода Spaniometra они остаются разделенными широким пространством. По направлению вперед петли матки не переходят за кишечное разветвление.
Форма яиц обычно овальная. Размеры яиц, так же как и толщина скорлупы, сильно варьируют у разных видов.