Яичник круглый, 0.13—0.26 мм в диаметре, лежит медианно несколько впереди брюшной присоски.
Тельце Мелиса лежит сейчас же позади яичника, между последним и брюшной присоской. Имеется лауреров канал.
Матка у незрелых экземпляров располагается медианно, в области дорзальной поверхности тела; у взрослых паразитов петли матки заполняют все интерцекальное пространство между яичником и задним семенником, проходя спереди дорзально от семенников. Мышечная терминальная часть матки входит в половую клоаку позади отверстия половой бурсы. Желточники расположены в основном экстрацекально, лишь частично налегая на кишечные стволы; начинаются они на некотором расстоянии позади заднего семенника и доходят до окончаний кишечных стволов. Яйца 0.15 — 0.17 х 0.056 —0.060 мм.
Neocladorchis poonaensis очень близок к родам Schizamphistomoides Stunkard, 1925, и Ophioxenos Sumwalt, 1926, хотя не может быть включен ни в один из них. От видов первого рода Neocladorchis poonaensis отличается большей величиной ротовых дивертикулов, а также тем, что семенники либо соприкасаются, либо частично перекрывают один другой; кроме того, кишечные стволы заходят дальше назад. От рода Ophioxenos описываемая форма отличается размером дивертикулов, расположением кишечных стволов в задней части тела, относительным положением семенников, размером желточных фолликулов, положением яичника и расположением матки.