Таким образом, исходя из всего сказанного, эволюция криптогонимид нам представляется в следующем виде.
Предки семейства Cryptogonimidae были паразитами пресноводных рыб рек Северо-Американского материка. В процессе эволюции из них выделились две группы: одна в своем развитии подразделилась на роды, приспособленные к жизни в пресноводных рыбах и является продолжением развития их предков в том же направлении, другая, очевидно, через каких-то проходных рыб, приспособилась к паразитированию в морских рыбах и тем самым получила возможность к более широкому распространению.
В процессе исторического развития криптогонимид, паразитирующих у пресноводных рыб, из общей ветви довольно рано выделилась группа, у представителей которой усиливались приспособления к паразитизму за счет большого развития органов прикрепления в виде хитиновых шипов на ротовой присоске и усиления органов размножения за счет более мощного развития матки и желточников, а также сближения половой присоски с брюшной присоской вплоть до их объединения в один общий орган — брюшно-половую присоску (Neochasmus).
Филогенетические взаимоотношения родов сем. Cryptogonimidae Ciurea, 1933 (по Ф. Н. Морозову)
Позднее из рода Cryptogonimus выделился род Caecincola, у представителей которого усиление приспособлений к паразитизму выразилось в увеличении половых желез и в особенности семенников, но наряду с этим произошло уменьшение половой присоски почти до полной ее редукции.
В развитии группы криптогонимид, являющихся паразитами морских рыб, очень рано произошло расхождение на две ветви, одна из которых распространилась в морях, омывающих Северную Америку, а другая — в Японском море, причем у первой ветви приспособление к паразитизму усиливалось путем удлинения матки, петли которой не только заполняют все межкишечное пространство позади брюшной присоски, но и пересекают ветви кишечника, в связи с чем желточники смещены в переднюю часть тела, а семенники — за кишечные ветви.
Род Siphoderina сохранил хорошо развитую половую присоску; в роде Siphodera половая присоска редуцирована, а число семенников увеличилось до восьми.