Семейство Cryptogonimidae Ciurea, 1933 объединяет 17 родов, распределенных в четырех подсемействах, причем род Centrovarium Stafford, 1904 мы оставляем в этом семействе условно, так как его типичный вид С. lobotes, по описанию Миллера (Miller, 1941), имеет бурсу цирруса.
Самый примитивный род этого семейства — Cryptogonimus Osborn, 1910 — характеризуется сравнительно слабо развитыми половыми органами, значительно удаленными от заднего конца тела, причем матка образует только одну продольную петлю. Брюшная присоска маленькая, ротовая присоска большая, но невооруженная. Половая присоска хорошо развита и не включена в генитальный синус. Окончательные хозяева представителей этого рода — пресноводные рыбы, что также указывает на сравнительную древность представителей рода Cryptogonimus.
Филогенетически наиболее близок к этому роду род Caecincola Marshal et Gilbert, 1905, представители которого паразитируют также у пресноводных рыб и имеют матку, состоящую из одной продольной петли, но отличаются от представителей рода Cryptogonimus сильно развитыми семенниками и сдвинутыми к переднему концу тела желточниками. Половая присоска здесь редуцирована и остается в виде маленького сосочка, расположенного в передней стенке генитального синуса.
Филогенетически близки к этим родам Allocanthochasmus Van Cleave et Mueller, 1932, и Neochasmus Van Cleave et Mueller, 1932, представители которых также являются паразитами пресноводных рыб, но эти формы, повидимому, моложе, чем Cryptogonimus и Caecincola. Они отличаются значительно более сильно развитой маткой, петли которой заполняют почти все пространство позади семенников. Кроме того, они имеют один ряд хитиновых шипов на ротовой присоске, а представители рода Neochasmus еще и множественный яичник. Половая присоска у обоих родов хорошо развита, но у вида Allocanthochasmus artus она находится впереди генитального синуса и отдалена от брюшной присоски, у A. varius половая и брюшная присоски сближены настолько, что соприкасаются между собой. У представителей рода Neochasmus половая присоска сливается с брюшной присоской.