Внутренние половые органы самцов спирурат представлены непарным семенником, за которым следует семепровод, заканчивающийся семеизвергательным каналом, открывающимся в клоаку.
Хвостовой конец самца снабжен характерными для самцов нематод элементами копулятивного аппарата. Спикулы у спирурат всегда имеются. В литературе описаны некоторые случаи отсутствия спикул (Tetrameres gynaecophila, Pseudophysaloptera soricina), но они нуждаются в проверке. Так, например, Бейлис (Baylis, 1934), характеризуя Pseudophysaloptera soricina, подчеркивает отсутствие у этого вида спикул, однако в дальнейшем Чэн (Chen, 1937) показал, что у Pseudophysaloptera имеются слабо заметные, вследствие малой хитинизированности, спикулы. К этому выводу пришел и Ю. Ф. Морозов (1960). Размеры спикул у разных спирурат сильно различаются. У Microtetrameres contorta длина левой спикулы относится к длине тела как 1 : 1,1. Размеры правой и левой спикул у большинства спирурат различны. Левая спикула, как правило, длинная и тонкая, правая короткая и массивная. Реже спикулы почти равны (Acuaria) или равны (некоторые Physaloptera и Thelazia).
Обычно спикулы имеют палочковидную или пластинчатую форму, заостренную на конце. Однако может наблюдаться и весьма сложная структура как спикулы в целом (Gongylonemoides), так и ее отдельных частей. В частности, дистальный конец длинной спикулы может быть расщеплен (Sciadiocara, Ancyracanthopsis). Довольно часто концы спикул бывают снабжены зазубринкой, подобно острию рыболовного крючка (Streptocara, Habronema), или копьевидны.
Рулек наблюдается у спирурат далеко не всегда, однако его наличие характерно для Habronema, Сугпеа, Hartertia. Форма рулька чаще всего напоминает усеченный на вершине треугольник, но бывает и иной, иногда довольно сложной конфигурации.
Задний конец тела самцов снабжен, как правило, хвостовыми крыльями, которые представляют собой уплощенные боковые выступы кутикулы, как бы окантовывающие хвост нематоды, начинаясь несколько кпереди от клоаки. У физалоптерид хвостовые крылья соединяются на брюшной стороне у своего начала, образуя своеобразную везикулу. Хвостовые крылья могут и отсутствовать (Tetrameres, Thelazia). Обычно они поддерживаются стебельчатыми хвостовыми сосочками, количество которых имеет немаловажное значение в систематике. Наиболее стабильным оказывается количество преанальных сосочков, их чаще всего две пары; большое число этих сосочков наблюдается у шисторофид. При отсутствии боковых крыльев сосочки бывают сидячими или коротко-стебельчатыми.
Брюшная поверхность самца в области клоаки нередко покрыта кути-кулярными возвышениями, размещающимися зачастую и на хвостовых крыльях. Эти возвышения имеют форму бугорков или прямоугольных пластинок. Они хорошо выражены у многих физалоптерид, у Habronema, Ascarops и Mastophorus.
Их функциональная роль заключается, очевидно, в облегчении фиксации самца к телу самки при копуляции. У самцов Rictularia на вентральной поверхности хвоста располагаются характерные полукруглые гребни.
Выделительная система
Выделительная система спирурат построена по обычному для нематод типу, т. е. состоит из двух каналов, идущих в боковых полях и соединяющихся близ переднего конца тела. Характерной особенностью выделительной системы рассматриваемой группы является, во-первых, то, что эти каналы не заходят кпереди от места своего соединения, вследствие чего их общая конфигурация напоминает перевернутое латинское «и»; во-вторых, парные субвентральные экскреторные железы, свойственные некоторым нематодам, у спирурат отсутствуют.