Тело диаптомуса резко делится на два отдела. Передний отдел состоит из головы и четырех (у некоторых видов пяти) грудных сегментов, плотно соединенных в компактное целое; короткий и узкий задний отдел образован брюшком, в состав которого входит три сегмента у самок и пять сегментов у самцов.
Первый брюшной сегмент называется генитальным, так как на нем открываются протоки органов размножения. К последнему, анальному, сегменту брюшка причленяетсяфурка, имеющая вид двух коротких придатков, называемых фуркальными ветвями; каждая фуркальпая ветвь несет пять коротких оперенных щетинок.
На голове находится шесть пар придатков: антеннулы, антенны, мандибулы, максиллулы, максиллы и максиллярные ноги; присутствие последних указывает на слияние с первичными головными сегментами первого торакомера (первичного грудного сегмента). Антеннулы длинные, достигают конца брюшка, а у некоторых видов — фуркальных щетинок. Правая антеннула самцов превращена в геникулирующую антеннулу, дистальная часть которой может складываться наподобие перочинного ножа и зажимать при копуляции придатки тела самки; находящиеся около сочленения членики вздуты и часто вооружены шипами или зубцами. Антенны двуветвистые; максиллулы пластинчатые; максиллы и максиллярные ноги одноветвистые.
Грудные ноги первых четырех пар, служащие для плавания, состоят из двучленистого протоподита и двух ветвей, из которых наружная ветвь, эксоподит, на всех ногах трехчленистая, а внутренняя ветвь, эндоподит, на ногах первой пары двучленистая, а на ногах трех следующих пар трехчленистая; обе ветви снабжены длинными, перистыми плавательными щетинками, а эксоподиты, кроме того, крепкими шипами. Ноги каждой пары соединены между собою хитиновыми пластинками, поэтому движение их совершается одновременно.
Ноги пятой пары резко отличаются по строению от остальных ног. У самок они симметричные с одночленистыми или двучленистыми эндоподитами и трехчленистыми эксоподитами. Ноги пятой пары самцов асимметричные. Правая нога больше левой; базиподиты двучленистые, эндоподиты слабо развиты; эксоподит левой ноги двучленистый, с различными придатками; эксоподит правой ноги большой, двучленистый, конечный членик с шипом по наружному краю и с длинным изогнутым хватательным когтем. Строение ног пятой пары характерно для каждого вида, и определение диаптомусов ведется почти исключительно по строению ног этой пары.