Гельминтофауна осетра различных водоемов Сибири, а также Амура обладает большим сходством.
В местах своего обитания сибирский осетр инвазирован специфичными для осетровых рыб — Diclybothrium armatum, Acrolichanus auriculatus, Cucullanus lebedevi (не отмечен в оз. Байкал), а также Ascarophis argumentosus (пока этот вид не зарегистрирован у осетра бассейна р. Оби и в плохо изученных реках восточнее Лены) и гельминтами рода Amphilina (кроме рек Сибири восточнее Лены), представленными в водоемах Сибири видом А. foliacea, а в бассейне Амура — A. japonica.
В гельминтофауне осетра каждого водоема неспецифичные гельминты встречаются в незначительных количествах. Так Diplostomum spathaceum, mete, найдены у осетра бассейна Оби, Иртыша и оз. Зайсан; Metechinorhynchus salmonis и Neoechinorchynchus rutili, Cyathocephalus truncatus — гельминты, встречающиеся у осетра в реках Енисее и Лене, Pseudoechinorhynchus clavula — у осетра оз. Байкал и Енисея.
Самые высокие количественные показатели инвазии гельминтами сибирского осетра отмечены для этого хозяина в Енисее, что связано, по-видимому, с большей по сравнению с другими водоемами Сибири биомассой бентоса в этой реке (Соколов, 1966), многие представители которого являются пищей для осетра, а некоторые из них служат промежуточными хозяевами гельминтов, паразитирующих у сибирского осетра.
Осетр Амура, помимо перечисленных выше специфичных для осетровых гельминтов, инвазирован Cystoopsis acipenseris, нематодой, характерной также для осетровых Понто-Каспийско-Аральского бассейна, а также пресных озер Северной Америки; из неспецифичных гельминтов амурский осетр инвазирован личинками Porrocaecum sp. Таким образом, гельмин-тофауна сибирского осетра представлена в основном типично пресноводными формами гельминтов, а также эвригалинными Ascarophis argumentosus, Amphilina foliacea, A. japonica, Cystoopsis acipenseris, полностью приспособившимися к развитию в пресных водах.
Acipenser sinensis Grau, 1834 и A. dabrianus Dumeril, 1968 — китайские осетры A. kikuchi Tanaca, 1901 и А. multisculatus Tanaca, 1908 — японские осетры
Очень редкие виды осетровых. Сведения о гельминтофауне этих видов рыб в литературе не встречены.