Как было показано выше, для большинства исследований географической изменчивости характерно отождествление закономерностей изменения видовых адаптивных признаков и собственно изменчивости.
Такой подход отражает ламаркистскую трактовку эволюционных механизмов. Между тем имеются данные, говорящие о принципиальном различии внутривидовых адаптивных процессов и перестроек в процессе видообразования. С.С. Шварц (1969) подчеркивает, что обитание вида в разных зонах часто приводит к формированию у популяций более существенных морфологических различий, чем между видами, специфичными для отдельных зон. По данным Л.H. Добринского (1962), большой относительный вес сердца характерен для многих птиц, обитающих на Крайнем Севере. Однако наиболее существенные отличия по этому признаку наблюдаются не между типичными тундровыми и более южными видами, а между субарктическими и бореальными популяциями широко распространенных видов. Типичные полярные формы поддерживают энергетический баланс в условиях Крайнего Севера без резко выраженных морфологических приспособлений, тогда как обитание в тундровой зоне популяций видов, адаптивные особенности которых не соответствуют субарктическим условиям, сопровождается существенными морфофизиологическими перестройками организма.
Внутривидовые адаптации и видообразование связаны с существенно различными изменениями организма. С.С. Шварц (1969) считает, что видообразование сопровождается в основном «тканевыми» перестройками, которые определяют более экономный и совершенный путь адаптации и специализации, чем морфологические приспособления. Можно привести множество примеров того, что внутривидовое варьирование признаков, связанное как с модификационными реакциями, так и с различиями генного состава и полиморфизмом популяций, во много раз перекрывает видовые фенотипические различия.
Достаточно напомнить об огромных трудностях определения видов многих групп животных, которые часто различаются только по кариотипическим или биохимическим признакам. Есть большие группы, разграничение видов которых вообще невозможно на основе только внешних морфологических признаков. В связи с этим в систематику усиленно внедряются методы кариологии, биохимии, иммунологии. Вместе с тем общеизвестны многочисленные примеры резко выраженных морфологических отличий подвидов, экотипов, морф, пород домашних животных. Часто норма реакции перекрывает варьирование видовых признаков в пределах крупных таксонов.