С экологической спецификой таксонов связана проблема их экологической целостности (Чернов, 1991).
Экологическая целостность надвидовых таксонов проявляется особенно отчетливо, когда спектр ценотических связей сохранеются при снижении до минимума числа видов. Так, фоновой вид дождевых червей сибирской тайги и тундры Eisenia nordenskioldi чрезвычайно пластичен, изменчив и политопен, вследствие чего играет не менее существенную роль, чем комплекс из десятка видов в европейских лесах. В данном случае потеря видового богатства компенсируется увеличением внутривидового разнообразия.
Специфику систематических групп особенно важно учитывать при анализе и моделировании временной динамики климата. По-видимому, более вагильные группы быстрее реагируют на изменения климата. Например, Куп (Сооре, 1986) показал, что субфоссильные остатки жуков в озерных осадках отражают кратковременные изменения климата, не выявляемые обычными методами палинологического анализа. Причина состоит в том, что древесные растения, благодаря меньшей вагильности и более длинным жизненным циклам, медленнее реагируют на изменения климата, чем жуки.
В качестве иллюстрации некоторых описанных подходов приведем два примера анализа географической изменчивости локальных биотических группировок в зависимости от климатических факторов. В первом случае анализ проведен на уровне сообществ, в качестве примера которых выбраны группировки почвенных беспозвоночных в 27 дубравах Русской равнины от Молдавии до Урала. Учеты проведены стандартным методом (почвенные пробы 25x25 см), что позволяет предполагать сравнимость не только видового состава разных таксономических групп, но и их количественных характеристик. Во втором случае анализ проведен на уровне локальных флор сосудистых растений и фаун наземных позвоночных заповедников Русской равнины.