В последнее время наметилась тенденция отмены ООПТ регионального уровня по мере возникновения серьезного интереса у хозяйствующих субъектов к эксплуатации на их территории природных ресурсов.
В связи с этим систему ООПТ регионального уровня нельзя расценивать как надежную и обеспечивающую должный уровень долговременной защиты эталонных лесных территорий. В этих условиях хороший индикатор уровня защищенности природных экосистем и ландшафтов - доля площади, приходящаяся на ООПТ федерального уровня (заповедники и национальные парки, хотя последние нередко функционируют лишь как обычные лесхозы с ощутимыми объемами собственных рубок). На федеральные ООПТ в четырех упомянутых выше крупнейших таежных регионах приходится: 3,4% общей площади лесов в Мурманской области; 0,9% в Архангельской области; 1,7% в Карелии и 6,3% в Коми. Лишь эти территории можно считать относительно надежно защищенными эталонами природы.
Иногда в качестве природно-заповедного фонда рассматриваются леса первой группы или отдельные их категории, на которые в таежной зоне приходится значительно большая площадь, чем на ООПТ. Это не правомерно хотя бы потому, что леса первой группы не являются особо охраняемыми природными территориями по действующему российскому законодательству (хотя некоторые ООПТ - заповедники и национальные парки -обязательно являются лесами первой группы). Леса первой группы представляют собой лишь ведомственную категорию лесов, в которых запрещены те или иные виды лесохозяйственной деятельности (разные в разных категориях лесов первой группы).
Что касается других видов деятельности (например, строительства дорог или добычи полезных ископаемых), то они никак не ограничены в лесах первой группы. Примерно в половине лесов первой группы разрешены рубки главного пользования, а во всех остальных лесах (если они не относятся к ООПТ) разрешены рубки промежуточного пользования и прочие рубки (которые в настоящее время мало отличаются от рубок главного пользования). В связи с этим расценивать леса первой группы как аналог ООПТ вряд ли целесообразно.