Как при экзогенном, так и при эндогенном нарушении биогенного наследования корневые ходы заполняются материалом почвы; характер этого заполнения зависит от видовой специфики корневых систем.
В качестве примера кратко рассмотрим особенности строения корневых систем наиболее широко распространенных в Восточной Европе видов деревьев -сосны обыкновенной, ели обыкновенной, дуба черешчатого и березы бородавчатой.
Сосна обыкновенная обладает одной из наиболее пластичных корневых систем. В хорошо дренированных свежих местообитаниях сосна образует глубокую корневую систему, характерной чертой которой является мощный стержневой корень, проникающий в почву на глубину 2-3 и более метров. В крайне сухих и крайне влажных условиях корневая система сосны приобретает поверхностное строение. Однако при любом типе строения корневой системы сосны основная масса ее корней располагается в поверхностном (до 60 см) слое почвы, причем чем ближе к поверхности почвы, тем интенсивнее выражается корненаселенность (Калинин, 1983).
Ель обыкновенная наиболее часто имеет поверхностную, плоскую корневую систему, однако способна формировать и глубокие корни. Формирование у ели стержневого корня, проникающего на глубину 1,5-2 м и более, и якорных корней, достигающих глубины 0,8-1 м описано как для дренированных почв северной тайги (Мелехов, 1980), так и для черноземов Орловской области (данные Розановой, цит. по: Ремезов, Погребняк, 1965).
Дуб черешчатый обычно формирует корневую систему, в которой присутствует как мощный стержневой корень, так и крупные якорные корни. Стержневой корень дуба проникает в почву на глубину 4-5 м, а иногда и глубже. Основное участие в корневой системе приходится на корни субгоризонтальной ориентации, наиболее интенсивно осваивающие верхние горизонты почвы в пределах 0-60 см (Ремезов, 1961; Калинин, 1983). Поверхностная корневая система с сильно разветвленными боковыми корнями у дуба формируется либо при повреждении стержневого корня, либо в крайне сухих местообитаниях (на мощных песках).