Выделение групп (совокупностей) видов растений

Задача разбиения видов на группы по различным критериям, также как и задача классификации описаний, традиционно решается кластерным анализом, ординацией или более специальными методами.

В геоботанической практике для группировки видов до последнего времени использовали, в основном, двумерный анализ индикаторных видов (Two-Way Indicator Species Analysis, TWINSPAN) и некоторые другие методы, представляющие ныне лишь исторический интерес (например, метод корреляционных плеяд и др.).

Метод TWINSPAN и программа с тем же названием (Hill, 1979) были созданы специально для решения классификационных задач в геоботанике. Они основаны на ординационной процедуре - методе взаимного усреднения, или анализе соответствий (RA-CA,). Формально метод относится к делительной (дивизивной) иерархической классификации; по алгоритму представляет собой последовательную дихотомию (объекты делятся на две группы, затем на 4, 8 и т.д.). Основная привлекательная сторона TWINSPAN заключается в форме вывода результатов - в виде двумерной упорядоченной таблицы, в которой описания и виды ранжированы по группам вдоль единственного гипотетического градиента: описания слева-направо и виды сверху-вниз. Структура такой таблицы близка к фитосоциологическим таблицам, традиционным для школы Браун-Бланке, что в большой мере объясняет сохраняющуюся популярность метода. Вместе с тем, TWINSPAN имеет ряд существенных недостатков. Прежде всего, поскольку TWINSPAN основан на алгоритме RA (СА), он испытывает те же проблемы, что и родительский метод. Подобно СА, TWINSPAN не способен обнаружить в данных варьирование более, чем по одному сильному градиенту. Далее, TWINSPAN изначально был предназначен для обработки данных по присутствию-отсутствию видов. Для учета обилия в методе вводится искусственная концепция псевдовидов, в то время как во многих других методах (например, в различных вариантах кластерного анализа) возможна непосредственная работа с видовыми обилиями. Наконец, дихотомическое деление ординационного пространства, лежащее в основе алгоритма, также небесспорно, поскольку далеко не всегда соответствует внутренней структуре данных.

Известно несколько вариантов TWINSPAN; из них упомянем COINSPAN (Carleton et al., 1997), в котором классификация производится на основе ССА.

TWINSPAN, несмотря на название, прежде всего метод классификации описаний, состоящий из этапов предварительной классификации, расчета индикаторных видов и окончательной группировки описаний с учетом найденных индикаторных видов. Собственно индикационная характеристика видов в TWINSPAN имеет качественный характер и трудно интерпретируема из-за концепции псевдовидов (вид может считаться индикаторным с одним обилием и не рассматриваться таковым при другом обилии).