Первоначальное выделение основных типов растительных сообществ на исследуемой территории проводится в ходе выполнения полевых работ. Далее, после ввода данных в компьютер, весь массив собранных геоботанических описаний классифицируется с учетом типов, выделенных в поле.
Классификация описаний заключается в формировании групп описаний, сходных по составу и структуре растительности; сходство определяется по спискам видов в описаниях с учетом их обилия в каждом ярусе. Выделенные группы описаний относят к тем или иным типам сообществ по принятой исследователем классификации. Наконец, определяется соответствие (близость) выделенных типов эталонным синтаксонам того или иного уровня в соответствующей классификационной системе растительности.
Наиболее часто при исследовании лесного растительного покрова используют доминантную, флористическую или эколого-ценотическую классификации растительности; их краткая характеристика дана ниже. Конкретная методика проведения типологии и классификации в большой степени обусловлена принятым исследователем классификационным подходом. Вместе с тем, можно выделить общие методические моменты.
Сходство описаний при классификации может устанавливаться либо эмпирически (группы сходных описаний формируются «вручную»), либо посредством использования формальных математических процедур, а также путем комбинирования этих подходов. Формальными методами, традиционно используемыми для выделения групп сходных геоботанических описаний, являются кластерный анализ, ординация и некоторые специальные методы типа TWINSPAN (Hill, 1979). Методы ординации описаны в предыдущем разделе, TWINSPAN описан ниже. Кластерный анализ является хорошо известным методом (точнее, группой методов), широко используемым во многих областях знаний и имеющим большое разнообразие вариантов.
В геоботанических исследованиях наиболее часто используют кластерный анализ с иерархическими аггломеративными (собирательными) стратегиями. Из этой группы наилучшие результаты, как правило, показывают две стратегии: метод Уорда (Ward) по матрице относительных евклидовых расстояний и гибкая бета-стратегия по матрице расстояний, полученных вычитанием из единицы коэффициента сходства Съеренсена (синонимы этой меры расстояния - коэффициенты Брея-Кертиса, Чекановского).
Несмотря на существование довольно большого современного арсенала формальных методов, при проведении классификации следует помнить, что любая исключительно формальная классификации всегда оказывается в той или степени «фальсифицированной» (Kershaw, Looney 1985), поскольку она всегда использует некоторое число искусственных критериев. В связи с этим, предпочтительнее использовать процедуры, комбинирующие формальные методы и экспертный анализ. Хорошая биологическая интерпретация результатов является одним их основных критериев выбора формального метода.