Женская половая система. Яичник небольших размеров, чаще округлый, овальный или неправильной формы, реже лопастной (Brandesia, Lecithodollfusia, Pleurolobatus и др.).
Наиболее часто лопастной яичник встречается у представителей подсемейства Pleurogeninae. Обычно яичник расположен на стороне, противоположной половому отверстию, латерально или субмедианно, реже медианно (некоторые виды родов Pleurogenes, Pleurogenoides, Limatulum и др.), причем для большинства видов характерно пре- или парацетабулярное и претестикулярное положение яичника; у Parabascus яичник может быть постацетабулярным, а у Mosesia и Phaneropsolus он располагается либо на уровне брюшной присоски, либо частично или полностью позади нее; посттестикулярное положение яичника характерно для родов Mehraorchis, Prosotocus и некоторых видов рода Phaneropsolus. Фурманн (Fuhrmann, 1928) в своей монографии по трематодам указывает четыре типа строения протоков женской половой системы.
Для плеурогенид характерно наличие семеприемника, открывающегося в лауреров канал, т. е. четвертого из указанных Фурманном типа. Семеприемник небольшой, обычно лежит позади яичника. Тельце Мелиса диффузное. Желточники состоят из фолликулов неправильной формы, реже округлых, лежащих разрозненно или плотной массой с дорзальным интервалом или без него в передней половине тела. Обычно желточники лежат по обеим сторонам тела, но у некоторых видов, паразитирующих у амфибий и имеющих латеральное и переднее положение бурсы (Mehraorchis jainiformis, Prosotocus dorsoporus, P. himalajai, P. kashabia и др.), желточники находятся только с правой стороны тела и могут проникать отдельными фолликулами постэкваториально.
Строение нервной системы (по Looss, 1894)
а — б — Pleurogenes claviger, в — Prosotocus confusus
Схема расположения протоков женской половой системы у плеурогенид (по Fuhrmann, 1928)
Изменчивость положения желточников у различных плеурогенид (оригинал)
а — Prosotocus confusus, б — Maxbraunium tubiporum, в — Mehraorchis jainiformis