Семенники почти сферические; передний имеет размеры 0,17—0,20 мм, задний — 0,19—0,21 мм.
Семяпроводы входят в семенной пузырь отдельно, у некоторых экземпляров наблюдается слияние семяпроводов перед входом в пузырек. Половая бурса 0,25—0,40 мм длины, огибает справа брюшную присоску, простираясь позади нее. У живых червей бурса лежит дорзально по отношению к брюшной присоске. Половое отверстие находится слегка влево от средней линии тела, между брюшной присоской и бифуркацией кишечника. В половой бурсе заключены семенной пузырек, простатические железы, простатическая часть и циррус, который может выдвигаться.
Яичник 0,15—0,18 мм в диаметре, лежит вправо от средней линии тела. Форма его сферическая. Семяприемник и лауреров канал имеются. Семяприемник расположен впереди яичника. Желточники простираются по бокам тела от уровня яичника до заднего края тела. Желточные фолликулы 0,009 мм в диаметре. Впереди желточного резервуара лежит тельце Мелиса. Матка расположена между яичником и брюшной присоской. Размеры зрелых яиц 0,055—0,086 мм.
Экскреторный пузырь длинный, достигает уровня брюшной присоски, в некоторых случаях бифуркации кишечника. Экскреторное отверстие слегка дорзальное. На уровне полового отверстия главный экскреторный ствол сужается в половину и разделяется на две ветви. Одна из них идет вперед к ротовой присоске, другая остается в связи с главным стволом и поворачивает назад. Обнаружены 42 мерцательные клетки, однако трудно сказать, каково их действительное количество.
Макфарлан изучил жизненный цикл Stegodexamene anguillae. Промежуточным хозяином для этого вида служат брюхоногие моллюски видов: Potamopyrgus antipodum, P. corolla и P. badia. Дополнительным хозяином являются рыбы Gobiomorphus gobioides и Galaxias brevipennis.