За ротовой присоской следует короткий префаринкс, переходящий в хорошо развитый, мышечный фаринкс, более или менее шаровидной формы, достигающий приблизительно половины диаметра присоски.
Длинный, тонкий пищевод доходит при нормальном сокращении тела до середины брюшной присоски и достигает 0,05—0,07 мм ширины. Сравнительно узкие кишечные стволы оканчиваются на небольшом расстоянии от заднего конца тела. Нервная система имеет типичное строение.
Экскреторный пузырь простой, трубчатый, с мышечными стенками, доходит впереди до уровня заднего семенника. На небольшом расстоянии от закругленного переднего конца пузыря в него впадают два главных экскреторных сосуда, которые на уровне брюшной присоски приближаются к краям тела и разделяются на передний и задний протоки с каждой стороны. Они идут каждый в своем направлении, образуя многочисленные крутые петли и от них отходят по два вторичных ответвления. Таким образом, на каждой стороне тела имеется 6 окончаний экскреторных сосудов. От каждого из них отходят по 4 капилляра, оканчивающихся пламененвидными клетками, общее число которых, следовательно, равно 48. Таким образом, формула мерцательных клеток у A. isoporum составляет 2 [(4+4+4) + (4+4+4)].
Половое отверстие расположено медианно, на расстоянии около 0,3 мм впереди брюшной присоски; оно ведет в довольно маленький, узкий половой атриум, на дне которого открываются мужской и женский протоки.
Семенники лежат в задней половине тела, довольно близко один позади другого. Они шаровидные, с гладкими краями и при сокращении тела изменяют свою форму, становясь поперечно- или продольно-овальными; диаметр их достигает около 0,5 мм. Спереди из каждого семенника берет начало семяпровод и оба протока соединяются над брюшной присоской в семенном пузырьке, который заключен в крупной, хорошо развитой половой бурсе; длина бурсы достигает 0,45 мм, ширина 0,20 мм; кроме семенного пузырька, бурса содержит простатическую часть и семяизвергательный канал.