От передне-медианного края семенников отходят семявыносящие каналы (vasa efferentia), которые направляются вперед и, сливаясь, образуют семяпровод (vas deferens), входящий в семенной пузырек (vesicula seminalis).
Семейство Microphallidae подразделяется на два подсемейства — Microphallinae и Maritrematinae — по признаку отсутствия или присутствия сумки цирруса. Виды, обладающие сумкой цирруса и копулятивным органом типа цирруса, являются филогенетически более древними. У трематод семейства Microphallidae конечные пути мужской половой системы претерпевают различные модификации и чрезвычайно разнообразно устроены.
У представителей подсемейства Maritrematinae семяпровод входит в семенной пузырек, лежащий перед брюшной присоской и заключенный в сумку цирруса. Семенной пузырек переходит в семяизвергательный канал (ductus ejaculatorius), который пронизывает циррус или папиллу. Простатические железы имеются и могут быть слабо или сильно развиты. Типичным циррусом обладают представители родов Рseudomaritrema, Maritreminoides и Pseudospelotrema.
У видов этих трех родов половое отверстие открывается левее брюшной присоски. У рода Microphalloides есть циррус, но половое отверстие открывается справа. У представителей рода Maritrema циррус заменяется мужской папиллой, которая может быть довольно длинной и снабжена шипиками (Maritrema magnicirrus, М. echinocirrata). Простатические железы могут отсутствовать, например, у Maritrema sobolevi, или же быть очень сильно развитыми, как у Maritrema kitanensis.
a — Psetidomaritrema posterolecithale Belop., 1952, поперечный разрез, виден ввороченный циррус (ориг.); б — циррус Pseudospelotrema japonicum Yamaguti, 1939 (ориг.); в — Maritrema sachalinicum Schumakowitsch, 1932, поперечный разрез, папилла торчащая из полового отверстия (ориг.)