Почти шаровидный или овальный яичник расположен слегка позади середины тела и позади половой бурсы медианно; он достигает 0,234— 0,273 X 0,312—0,390 мм, оотип лежит у задней части яичника; на этом же уровне открываются желточные протоки и тельце Мелиса.
Нисходящая ветвь матки образует многочисленные поперечные петли, расположенные между кишечными стволами в правой стороне тела; дойдя до переднего края переднего семенника, матка переходит на противоположную сторону, формируя восходящую ветвь, которая тоже образует поперечные петли до яичника; в дальнейшем матка проходит вдоль левого края яичника, направляясь параллельно половой бурсе к метратерму, также расположенному параллельно половой бурсе; метратерм широкий, его длина 1,500—1,677 мм.
Желточники состоят из многочисленных шаровидных фолликулов, расположенных латерально от кишечных стволов; они начинаются позади брюшной присоски и оканчиваются немного впереди переднего семенника. У одних экземпляров желточники расположены симметрично, у других правый начинается несколько впереди левого. Более крупные фолликулы размером 0,049x0,041 мм, мелкие 0,008 мм.
Экскреторное отверстие лежит вентро-терминально, экскреторный пузырь крупный.
Яйца с желтой гладкой оболочкой, без крышечек, 0,0490x0,0143 мм.
Кабальеро указывает, что Cercorchis dissimilis отличается от остальных видов рода Cercorchis отсутствием префаринкса и пищевода.