Мужской половой аппарат состоит из семенников, отходящих от них семявыносящих сосудов (vasa efferenlia), которые соединяются, образуя общий непарный выводящий проток (vas deferens). За vas deferens следуют семенной пузырек, простатическая часть и семяизвергательный канал.
Семенники. Семенников обычно два, изредка один, как, например, у представителей семейства Haplosplanchnidae. Они округлой или овальной формы, цельнокрайные, в виде исключения гроздевидно-фолликулярные.
Так у представителей семейства Syncoeliidae семенники распались на отдельные крупные фолликулы, объединенные двумя vas efferens в две группы.
Vasa efferenlia соединяются в один vas deferens, который входит в семенной пузырек. Исключением являются представители подсемейства Haplosplanchninae, лишенные семенного пузырька; функцию пузырька у них выполняет vas deferens.
Как правило, семенники локализуются позади брюшной присоски. Исключением является род Prosorinchus (семейство Dinuridae), у представителей которого они находятся впереди брюшной присоски.
Семенники обычно расположены впереди яичника и желточников.
Значительно реже семенники лежат позади яичника, как это имеет место у представителей семейств Нaplosplanchnidae, Plychogonimidae и подсемейства Gonocercinae из семейства Halipegidae.
В виде исключения между двумя семенниками лежит яичник (семейство Bathycotylidae).