Кроме известных ранее родов трематод — Fasciola L. (=Distoma Retz.), Festucaria Schr. ( = Mono stoma Zed.) и Lingua tula Frol., Рудольфи включил в свою систему новый род Amphistoma с видом A. macrocephalum (= Strigea strigis) от сов.
Он не нашел у экземпляров этого вида присосок и принял за них отверстие головной чаши и полового атриума, что нашло свое отражение в диагнозе и родовом названии. В 1803 году род Fasciola Рудольфи пополняет рядом новых видов, в числе которых диплостоматида F. ехсаvata (ныне Tylodelphys excavata) из кишечника белого аиста. В более поздних работах Рудольфы отказывается от названия Fasciola и пользуется названием Distoma. Видовой состав родов трематод расширяется, особенно двух родов Distoma и Amphistoma. К 1809 году в составе первого рода Рудольфы регистрирует 60 видов, в составе второго — 9. В 1819 году число видов в первом роде возросло до 162, во втором — до 21. В 1809 году Рудольфи публикует систему гельминтов, в которой трематод рассматривает в качестве отряда, состоящего из 4 родов. Та же система, только с более расширенным видовым составом, приведена им и в «Entozoomm. synopsis».
Система трематод (по Рудольфи, 1819)
Отряд Trematoda
Род Monostoma.
A. Pori apertura inf era — Hypostoma (3 вида).
B. Pori opertura antica — Monostoma (27 видов, в их числе — M. cornu, Rud.).
Род Amphistoma.
A. Capita discreto с видами:
A. longicolle Rud. от выпи, озерной и черноголовой чаек,
A. serpens Nitzsch от скопы,
A. macrocephalum от соколов и сов,
A. microcephalum от кедровки,
A. isostomum Rud. от пеганки,
A. gracilis Rud. от большого и малого крохалей,
A. erraticum Rud. от краснозобой гагары и бекаса,
A. umigerum Rud. от прудовой лягушки,
A. cornu Nitzsch от серой и большой белой цапель,
A. cornutum Rud. от золотистой ржанки,
A. sphaerula Rud. от серой вороны,
A. pileatum Rud. от речной крачки,
A. denticulatum Rud. от зимородка.
B. Capite contunio (8 видов)
Род Distoma
1) inermia (99 видов, в их числе — D. excavatum Rud. и D. alatum Zed.),
2) armata (63 вида),
Род Poly stoma (5 видов).