Протяженность матки различна. Наиболее короткой маткой обладают циатокотиляты. У некоторых из них в матке иногда развивается только одно яйцо (Paracoenogonimus viviparae).
У бисегментных форм, как правило, матка не выходит за пределы заднего сегмента. У видов рода Alaria петли матки могут проникать и в передний сегмент к основанию органа Брандеса. К стенке этого органа способна прилегать петля матки у видов родов Paracoenogonimus и Braunina. Весьма своеобразное расположение матки наблюдается у паразита сумчатых — Duboisiella proloba. У этой трематоды петля матки заходит далеко в направлении к головной чаше до уровня 3/4 переднего сегмента.
Количество яиц в матке бывает различным, но в большинстве случаев не бывает большим. У мелких циатокотилят (роды Paracoenogonimus, Prohemistomum) в матке одновременно развивается одно — три яйца. У крупных стригеид (род Parastrigea) количество яиц в матке иногда исчисляется десятками и сотнями.
Желточники у стригеидид сильно развиты. Наиболее часто они состоят из скопления мелких многочисленных фолликулов. У циатокотилят фолликулы относительно крупны и число их невелико.
У бисегментных форм желточные фолликулы располагаются вдоль оси тела в обоих сегментах или только в одном из них. Характер их распространения является таксономическим признаком подсемейственного значения. В подсемействах Strigeinae,Diplostomatinae и Proterodiplostomatinae фолликулы желточных желез располагаются в обоих сегментах, в подсемействах Cotylurinae и Crassiphialinae они сосредоточены только в заднем сегменте, за исключением вида Cotylurus hebraicus от лысухи, у которого отдельные фолликулы способны проникать и в область головной чаши. В переднем сегменте фолликулы концентрируются у представителей подсемейств Alariinae, Polycotylinae и Duboisiellinae.