Первичная экскреторная система стригеидид не имеет принципиальных отличий от экскреторной системы других дигеней.
Ее функция экскреторная и осморегулирующая. Эта система сопровождает все стадии онтогенеза, начиная с мирацидия. У мирацидия и спороцист экскреторная система парная и напоминает своей структурой экскреторную систему моногеней и турбеллярий. У церкариев, мезоцеркариев и метацеркариев парная в своем генезисе система превращается в симметричную, но непарную систему с непарным экскреторным пузырем и непарной экскреторной порой.
Экскреторный пузырь и непарный хвостовой сосуд церкариев являются гомологами первичных парных коллекторных латеральных сосудов. Экскреторное отверстие церкария парное. После утери хвоста ее роль выполняется просветом непарного хвостового сосуда, который в виде небольшого отрезка сохраняется в теле церкария между экскреторным пузырем и задней границей тела. Следовательно, экскреторное отверстие мезоцеркария, метацеркария и мариты гомологично просвету хвостового сосуда церкария.
Разбирая вопрос о гомологии отдельных элементов экскреторной системы стригеидид, мы руководствуемся тем фактом, что эта система у стригеидид возникает в процессе онтогенеза дважды. Впервые она появляется у мирацидиев и исчезает у спороцисты. Вопрос о том, является ли экскреторная система спороцисты развившейся системой мирацидия или она возникла самостоятельно, не решен до настоящего времени. С большой долей вероятности можно предположить существование между этими системами генетической связи. Вторично экскреторная система возникает у церкария как у первой стадии нового поколения, о чем говорилось выше.