У церкария Cotylurus cornutus вторичная экскреторная система образована поперечной комиссурой, пролегающей преацетабулярно между концами латеральных сосудов. У метацеркария путем постепенного усложнения она принимает вид, свойственный тетракотилидному типу строения (Матиас, 1925).
Онтогенез других типов строения вторичной экскреторной системы стригеат не изучен.
Развитие вторичной экскреторной системы у циатокотилят идет иным путем, чем у стригеат. Зачатки этой системы появляются у зародышей церкариев еще до того, как начинает формироваться хвост, когда появляются первые пары терминальных органов первичной экскреторной системы. Зачатки вторичной экскреторной системы у циатокотилят, в отличие от стригеат, возникают в виде двух пар дивертикулов. Первая пара, как и у стригеат, возникает на вершине петли первичных латеральных сосудов. Вторая пара дивертикулов образуется на внутренней стороне средней части тех же сосудов. Эти зачатки экскреторной системы возникают до слияния первичных латеральных сосудов друг с другом.
Темпы развития этих двух пар зачатков различны. Вторая пара растет относительно быстро по направлению кпереди и медиально и вскоре достигает уровня первой пары каналов, растущих также по направлению к ротовой присоске. Вслед за этим происходит слияние передних участков второй пары каналов друг с другом в непарный медианный канал и с передними концами каналов первой пары. В результате образуется два замкнутых поля. После слияния каудальной части первичных латеральных сосудов система каналов церкария образует три замкнутых поля (не считая островка Корта). Дальнейшее усложнение системы отмечается у метацеркария и идет по пути возникновения анастомозов между главнейшими каналами; возникновения параллельных стволов и увеличения просвета каналов.