Яичник почти шаровидный, расположен слева, в пространстве, ограниченном кишечными стволами, между передним семенником и семяприемником; длина его достигает 0,402— 0,490 мм при ширине 0,297—0,490 мм.
Тельце Мелиса лежит впереди семенников, между кишечными стволами; оно ограничено сзади передним семенником, слева — яичником и семяприемником, справа — петлями матки и семенным пузырьком. Имеется лауреров канал. Семяприемник имеет форму мешка, расположен наискось между яичником и семенным пузырьком и достигает 0,420—0,720 X 0,227—0,367 мм; его проток позади яичника образует одну петлю и входит в тельце Мелиса. Матка занимает правую часть пространства кнутри от кишечных стволов между брюшной присоской и передним семенником.
Метратерм проходит несколько вперед за половое отверстие и заворачивает обратно к гермафродитному протоку, с которым и соединяется. Яйца с толстой оболочкой желтоватого цвета, с маленьким гребешком па противоположном от крышечки полюсе; они достигают 0,068—0,072 X 0,044—0,048 мм. Желточники начинаются немного впереди переднего края брюшной присоски и простираются до заднего конца тела; от начала до уровня заднего края заднего семенника они лежат за пределами кишечных стволов и в их области, а дальше образуют 4 продольные полосы, сливающиеся позади заднего семенника. Желточные протоки соединяются в области тельца Мелиса. Экскреторный пузырь трубчатый; экскреторное отверстие субтерминальное. Лимфатическая система не была обнаружена.
Apocreadium caballeroi включен в род Apocreadium семейства Schistorchidae благодаря наличию трубчатого гермафродитного протока, положению полового отверстия впереди брюшной присоски, расположению матки, отсутствию половой бурсы и строению экскреторного аппарата.
A. caballeroi отличается от ранее описанных настолько малой длиной гермафродитного протока, что иногда создается впечатление будто метратерм и простатическая часть входят в половое отверстие независимо один от другого. Кроме того, характерна форма семенников и заднего конца тела, который всегда бывает согнут и кажется способным втягиваться.