Круглый яичник, достигающий 0,08 X 0,1 мм, лежит латерально, несколько позади брюшной присоски, от которой он отделен частью половой бурсы.
Яйцевод соединяется вблизи тельца Мелиса с общим желточным протоком. Тельце Мелиса расположено между яичником и передним семенником. Извитая матка тянется сначала в заднем направлении почти до уровня окончаний кишечных стволов, проходя между семенниками; затем матка заворачивает и в виде восходящей ветви проходит рядом с нисходящей. Приблизительно на уровне тельца Мелиса восходящая ветвь загибается к левой стороне тела, образует при этом несколько петель и направляется к половому отверстию. Метратерм имеет тонкие стенки.
Обширные желточники налегают на кишечные стволы и почти достигают латеральных краев тела, простираясь от уровня пищевода до окончаний кишечных стволов и уровня задних петель матки. Желточные фолликулы округлые (0,012—0,015 мм в диаметре) или продолговатые. Оба желточника остаются разделенными, и только в области пищевода единичные фолликулы заходят и соединяются в медианной области, а в задней части тела окончания желточников сближаются. Тем самым, этот вид относится к подроду Multiglandularis. Главные желточные протоки расположены поперек тела дорзально, непосредственно впереди переднего семенника. Имеется ясно выраженный желточный резервуар. Яйца достигают 0,030—0,037 X 0,017—0,022 мм.
По мнению Джонстона и Энгла, этот вид очень близок к P. muris (Tanabe, 1922) от крыс и мышей Японии.
Однако Plagiorchis (Multiglandularis) jaenschi отличается от Plagiorchis (Multiglandularis) muris значительно более коротким и тонким телом, меньшим размером обеих присосок, семенников и яичника, положением полового отверстия непосредственно у бифуркации кишечника, положением яичника ближе к брюшной присоске, а заднего семенника дальше от заднего конца тела, меньшим числом желточных фолликулов в заднем конце тела, где оба поля почти раздельны.