Наименование рода Choanomyzus происходит от choan — воронка и myzus — присоска и имеет отношение к присоске, имеющей одно большое и одно маленькое отверстия.
Описывая эту трематоду, Мантер и Кроукрофт указывают, что она существенно отличается от других родов семейства Opistholebetidae. Конечно, она не имеет никакого отношения к истинным Paramphistomatidae. Условно ее можно отнести к семейству Opistholebetidae на основании расположения брюшной присоски на заднем конце тела и наличия группы желточных сосочков позади брюшной присоски. Шероховатость кутикулы тоже наблюдается у Opistholebes. Поперечная петля матки впереди полового отверстия очень напоминает Opistholebes adcotylophorus Manter, 1947.
Своеобразная изогнутость цирруса соответствует признаку, описанному Ozaki (1937в) у Gyliauchen и Flagellotrema, входящих в родственное семейство Gyliauchenidae. Однако Choanomyzus отличается от Opistholebetidae по целому ряду важных признаков, как то: отсутствие семяприемника и пигментных пятнышек, отсутствие посторального кольца, распространение петель матки в задней части тела, четырехлопастный яичник и Y-образный экскреторный пузырь.
У Choanomyzus наблюдаются некоторые интересные аналогии с Fellodistomatidae, включая изогнутый циррус, отсутствие семяприемника и распространение матки в задней части тела. Кроме того, роды феллодистомид обладают лопастным яичником, Y-образным экскреторным пузырем и симметричными семенниками. Дорзальное отверстие брюшной присоски, насколько известно, ни у одной трематоды не встречается. Значение его непонятно, а размер вероятно слишком мал, чтобы оно могло иметь значение при присасывании. Своеобразными признаками являются также раздутость передней части простатического пузырька в половой бурсе и интервал в круговых мышцах вокруг отверстия брюшной присоски.