Церкарии Е. pancreaticum относятся к микроперкарному типу: имеют маленький хвостовой придаток.
Они удлиненно-овальной формы, сплющенные дорзо-вентрально, достигают 0,33—0,37 мм длины и 0,112—0,140 мм наибольшей ширины. Кутикула не имеет шипиков, за исключением передней и задней областей, где она покрыта очень мелкими шипиками. Ширина маленького толстого хвостика обычно превышает его длину: длина его достигает 0,027—0,033 мм, а ширина 0,034—0,048 мм. На заднем конце хвоста имеются мелкие шипы, подобные тем, которые имеются на хвосте церкариев Paragonimus.
Хвост содержит 12—14 круглых ядер, которые хорошо видны в живом церкарии. Ротовое отверстие церкария направлено вентро-терминально. Оно окружено мускульной ротовой присоской, достигающей 0,049—0,055 мм в диаметре. Маленький стилет располагается в маленькой полости перед дорзальной стенкой ротовой присоски; его кончик направлен вперед. Брюшная присоска лежит в средней части тела, достигает 0,05—0,06 мм в диаметре. Префаринкс чрезвычайно короткий, фаринкс шарообразный, 0,014—0,020 мм в диаметре.
Длинный тонкий пищевод раздваивается на кишечные ветви впереди брюшной присоски. Четыре пары желез проникновения занимают медианную область, примыкающую к длинному пищеводу. Их протоки обычно соединены в два пучка. Направляясь вперед извилистым путем они открываются в маленький мешочек, заключающий в себе стилет. Пять пар латеральных желез проникновения занимают пространство по обеим сторонам брюшной присоски.