По филогенезу сюда следует отнести выстилку ротовой полости (кроме преддверия), глотки, пищевода, а также железистые эпителии экзокринных и эндокринных желез, возникающих из упомянутых покровных тканей.
Сюда же относятся и все эпителии органов дыхания, кроме обонятельного. Возникновение всех этих эпителиев из первичной жаберной кишки хордовых хорошо прослеживается по серии современных хордовых животных разного уровня организации. И в онтогенезе позвоночных бранхиогенные эпителии развиваются из одного зачатка.
Сравнительная анатомия и эмбриология [Шмальгаузен, 1947; Борисов, 1974, 1978в] указывают, что по крайней мере часть пищевода позвоночных возникла из жаберной кишки провертебрат. Каудальная граница жаберной кишки остается, однако, не вполне ясной из-за того, что сравнительная анатомия не дает четких указаний, из какой части пищеварительной трубки возник желудок позвоночных. В гистологическом смысле здесь также имеются трудности, которые удобно рассмотреть после того, как будут обсуждены свойства бранхиогенных эпителиев, составляющих в филогенетическом, онтогенетическом и отчасти в морфологическом смысле достаточно тесную группу.
Морфология бранхиогенных эпителиев противоречива. Сходство выстилки ПОПТ с эпидермисом у млекопитающих действительно велико. В слюнных железах вследствие наличия миоэпителиальных клеток эпителий концевых отделов двухслойный; в выводных протоках этих желез находим многорядный и многослойный эпителий. Бранхиогенные эндокринные железы обнаруживают явное или скрытое сходство с многослойными эпителиями. При культивировании в стекле эпителии передней доли гипофиза и тимуса образуют многослойные пласты [Хлопин, 1946].
Эпителий тимуса способен и к синтезу кератогиалина. Впрочем, источник этой особенности трудно объяснить совершенно однозначно. К синтезу небольших количеств цитокератинов способно большинство эпителиев [Osborn, 1983] и даже эпителиоморфные пласты, такие как бластодерма курицы (далее). Поэтому и различия эпителия пищевода от эпидермиса по набору кератинов [Banks-Schlegel, Harris, 1983] можно понимать и как принципиальные различия и как несущественные варианты чисто адаптивного характера. Эпителий щитовидной железы может преобразовываться в многослойный плоский при длительном раздражении дегтем [Дунаев, 1965].