Тем самым отпадает необходимость считать гаструляцию амниот двухфазным процессом (закладка энтодермы, а затем хорды и мезодермы).
В действительности хорда и кишечная энтодерма закладываются одновременно. Тем не менее гаструляцию амниот неудобно считать процессом образования двухслойного зародыша. Порядок закладки энтодермы, хорды и мезодермы у краниот сходен с ланцетником только в ларвальном теле. В постларвальной области [Светлов, 1957; Борисов, 1974, 1978б] образование мезодермы и хорды сдвинуто на более ранние стадии развития, и эти зачатки обнаруживают здесь разную степень независимости (вплоть до полной) от энтодермы. Следствием оказывается то, что строго двухслойного зародыша у краниот мы не обнаруживаем. Эта фаза филогенеза в отличие от ланцетника в чистом виде не рекапитулирует.
Но в гаструляции имеется и гистологическая сторона. Зародышевые листки представляют измененные первичные ткани предка. С этой точки зрения гаструляцию можно считать процессом закладки эквивалентов первичных тканей. И в этом качестве она сравнима с гаструляцией, например, турбеллярий.
Филогенетические процессы, связанные с превращением щелевидного первичного рта в рот и анус, в измененном виде воспроизводятся в начале невруляции. Напомним, что в филогенезе полярно расположенный первичный рот затем смещается на брюхо животного, которое позже становится спиной позвоночного. При смыкании середины щелевидного рта циркуморальное нервное сплетение превращается в мерцательную нервную полоску.
При превращении этой полоски в желобок и далее в трубку мерцательные клетки становятся эпендимой, а подлежащие невроны образуют собственно нервную ткань ЦНС. Края нервной пластинки преобразуются в нервный гребень. Предполагалось, правда, что возникающие в онтогенезе из гребня чувствительные нейроны в филогенезе выделяются из спинного мозга [Сепп, 1949], но доказательств этого нет, на сравнительном материале предполагаемый процесс не прослеживается.