Направляющиеся к щупальцам гребневиков гастроваскулярные каналы заканчиваются в их основании. В отличие от книдарий внутри щупалец энтодермы нет, а имеется мускулатура и мезоглея.
Различия могут иметь три объяснения. Первое — мышцы щупалец гребневиков выделились из эктодермы (что чаще и предполагается). Не ясно, были ли щупальцы первоначально однотканевыми образованиями или входившие в них выросты энтодермы редуцировались? Не получает объяснения и тесная связь в онтогенезе зачатка мышц с энтодермой. Второе — щупальцы возникли поздно, уже имевшаяся у животного мышечная ткань сразу вошла в состав щупалец. Принятие этой гипотезы затруднено как анатомическим сходством гребневиков с книдариями, так и материалами, приведенными далее. Третье — щупальцы образовались из эктодермы и энтодермы, но позже миоэпителиальные клетки энтодермы преобразовались в мышечные, и характер этого материала изменился. Последняя гипотеза интересна ввиду того, что щупальцевидные двухтканевые образования встречаются у многих беспозвоночных. Их внутренние ткани либо энтодермального, либо мезодермального происхождения. Но если верно, что мезодерма возникла из энтодермы, то энто- и мезодермальные ткани внутри щупалец обнаруживают родство, а все щупальцы — общий план строения.
Протогастреады имели много черт сходства с гребневиками: движение ртом вперед, аборальный орган, архэнтерон сложной формы, щелевидный рот. Но гистологически протогастреады были гораздо примитивнее. При эволюции к гребневикам клетки протозойной дифференцировки исчезли, а затем мультифункциональные ткани из метазойных клеток, сходные с тканями книдарий, специализировались. Мерцательный способ движения усовершенствовался развитием гребных пластинок, и аборальная зона, ранее двигательная, стала только управлять движением. Смена функций «гребных» клеток этой зоны привела к возникновению статоциста. Щупальцы увеличились, усовершенствовались и сдвинулись аборально. Ввиду неясности их первичной структуры, трудно судить о происхождении мышц гребневиков. Гребневики — интересный пример преимущественно гистологической эволюции при малой анатомической перестройке.