Анализ паренхимы губок более затруднителен. Возникающие проблемы удобно рассмотреть в связи с разбором возможного пути от бластеи к губке.
Заметим пока, что восстановление губок из взвеси клеток успешнее протекает в тех случаях, когда образуются конгломераты клеток из хоаноцитов и археоцитов [Волкова, 1977; Borojevic, 1963]. Несмотря на известную способность клеток губок к смене дифференцировок, две ткани губок достаточно различаются друг от друга — при наличии клеток представителей обоих тканей реорганизация протекает легче. Эти различия, может быть, даже глубже, чем различия тканей у гастреад. Заметим также, что значение и реальность Proterospongia остаются неясными. Возможно это фрагмент колонии хоанофлагеллят [Kerkut, 1960]. Поэтому филогенетические построения правильно начать от бластеи.
Предок-бластея, вероятно, содержала опорный гель. Межклеточное вещество паренхимы губок весьма сложно [Ebert-Rothe, 1962], и его надо предполагать очень древним, берущим начало от бластеи. Половые клетки находились в бластодерме — об этом говорят особенности созревания гоноцитов губок. Для делений созревания последние выходят в жгутиковые камеры, а затем возвращаются в паренхиму. Это можно сопоставить с особенностями млекопитающих: их сперматогенез нормально течет при температуре ниже температуры тела, что является следствием происхождения млекопитающих от пойкилотермных рептилий.
Потребность созревающих гоноцитов губок выйти из внутренней среды организма можно понять так, что у предков губок гоноциты находились в контакте с внешней средой. Одновременно наличие у губок клеток-сперматофоров указывает на то, что во внутреннюю среду гоноциты губок ушли не вчера. Предположение, что у бластеи гоноциты находились в бластодерме, а у паренхимеллы отошли внутрь, учитывает обе вышеуказанные особенности губок.