При дальнейшей эволюции происходит разделение клеток метазоона на две группы — внешние и внутренние.
Этот процесс представляет особый интерес как для понимания гаструляции современных животных, так и для установления их филогении.
Основными конкурирующими теориями уже более ста лет являются теории гастреи и паренхимеллы, хотя теория плакулы (реже) также рассматривается как возможная. Рассмотрение теории паренхимеллы затруднено тем, что в настоящее время она существует уже в нескольких резко различных вариантах [Борисов, 1980]. Но на основе ранее сказанного можно рассматривать лишь варианты, где паренхимелла выводится из бластеи. Теория гастреи сейчас имеет мало сторонников, но ее также необходимо здесь рассмотреть.
Подводя итог дискуссиям, А. В. Иванов [1968а] указывает следующие слабости теории гастреи: необоснованное перенесение феноменов онтогенеза в филогенез, эти ранние стадии онтогенеза неправильно поняты; неверно допущение, что инвагинация первична; не объяснено, почему в филогенезе произошла гаструляция; нет экологического и физиологического обоснования теории. Недостатки теории указаны верно. Но «обвинения» сходного характера могут быть предъявлены и теории паренхимеллы.