Разнообразие колоний современных хоанофлагеллят [Hollande, 1952] не позволяет считать конкретный современный вид реальной моделью предка многоклеточных животных.
Здесь целесообразно пожертвовать деталями и попытаться реконструировать лишь основные черты такого предка. Для этого необходимо прежде всего решить, мог ли быть предок-протист сексуальным.
Истоки полового процесса многоклеточных животных оценивают различно: допускается появление полового процесса при превращении колоний в многоклеточных животных [Иванов, 19686] и наличие полового процесса у предка-протиста [Полянский, 1971]. Из современных протистов половой процесс имеется у части амеб, у солнечников, споровиков, инфузорий, а также у зеленых фитомонад. Половой процесс не найден пока у протомонадин. В группу протомонадин входят и хоанофлагелляты. Впрочем, эта группа исследована еще недостаточно, и не исключено, что у части ее представителей половой процесс будет обнаружен. Кроме того, протозоологи допускают возможность утраты некоторыми протистами имевшегося ранее полового процесса [Мясоедов, 1935; Hawes, 1963].