К модификационному классу относится сезонный и локальный полиморфизм. Различающиеся формы, хотя и разобщены во времени или пространстве, развиваются на единой генотипической основе и стоят друг к другу в отношении родительского и дочерного поколения или являются братьями и сестрами.
Этим сезонный и локальный полиморфизм отличается от географическою и экологического пути расообразования. Процентное соотношение форм устанавливается как результат действия самого стрелочного механизма. Оно варьирует в широких пределах. К модификационному классу полиморфизма относятся и различия между плодовитыми самками и их бесплодными сестрами в колониях медоносной пчелы. Условия кормления определяют, разовьется та или другая форма. Среда служит пусковым механизмом реализации различия и в случае полового диморфизма у червя Bonellia.
Черви, прикрепляющиеся к субстрату, становятся самками. Особи, поселяющиеся в половых путях самок, превращаются в самцов.
Модификационный класс можно подразделить на подклассы в зависимости от характера того внешнего фактора, который реализует различия. Таким фактором может быть температура, влажность, пищевой режим или воздействия, исходящие от представителей противоположного пола. В качестве первого приближения к такой классификации можно наметить два подкласса модификационного полиморфизма: климатический и биоценотический. Климатический подкласс охватывает сезонный и локальный полиморфизм, биоценотический подкласс — различие между плодовитыми и бесплодными самками в колониях перепончатых (трофический полиморфизм) и различие самцов и самок Bonellia (экзогормональный полиморфизм).
К эпигенетическому классу балансированного полиморфизма относится возрастной полиморфизм, смена гапло- и диплофазы, функционирование гермафродитных особей сперва в качестве представителей одного, а затем в качестве представителей другого пола. К этому классу относятся также различия между рабочими пчелами, выполняющими различные работы в улье. Разделение труда между ними — результат возрастной дифференциации. Каждая пчела проделывает все виды работы в определенной последовательности.