Прерывистый характер различий между формами, возможность скрещивания, рождение всех форм в потомстве каждой пары показывает, что полиморфизм осуществляется на единой генотипической основе.
Генотипически все особи полиморфного вида сходны друг с другом по всем наследственным факторам, за исключением тех, которые образуют стрелочный механизм, реализующий различия с помощью расщепления. Рождение всех форм полиморфного вида в потомстве одной особи или друг от друга — решающий момент для определения, является ли разнообразие форм полиморфизмом или экологическим обособлением части вида. Отсутствие барьеров для совместного существования и пространственного перемешивания особей — обязательный критерий полиморфизма.
Полиморфизм в узком смысле слова наблюдается у видов, размножающихся амфимиктически. Половой процесс, поддерживая единство генотипического состава популяции, препятствует образованию на основе полиморфизма группового разнообразия. Разнообразие клонов у клонального вида или разнообразие, связанное с географической, экологической или генетической изоляцией у видов, размножающихся путем скрещивания, не входит, таким образом, в понятие полиморфизма. Переход к апомиксису или агамному размножению представляет собою утерю одного из интегрирующих механизмов вида и сопровождается распадом первоначально полиморфного вида на изолированные друг от друга формы. Прерывистое межвидовое разнообразие возникает сразу, имитируя скачкообразную эволюцию [Mather, 1955].
Существование полиморфизма возможно только в сочетании с интегрирующими механизмами. Полиморфизм — показатель наличия этих интегрирующих механизмов, показатель преобладания центростремительных сил над центробежными. Полиморфизм — это выражение целостности вида.