Серьезные трудности возникли при изучении эволюции системы трансляции, при объяснении происхождения рибосомного аппарата, механизм работы которого оказался универсальным для всех живых организмов.
Экспериментальное воссоздание упрощенной системы трансляции, так называемой неэнзиматической транслокации, недавно осуществленное Л. П. Гавриловой и А. С. Спириным, позволило предположить, что подобные примитивные системы, в которых заложены основные принципы работы рибосомы, могли быть предшественниками современной системы трансляции.
Существует и крепнет тенденция комплексного изучения эволюции с использованием методов морфологии, биохимии и физиологии. Процессы биохимической эволюции подчас истолковываются в понятиях морфологической теории эволюции А. Н. Северцова. Так, появление в ходе биохимической эволюции механизмов, которые обеспечивали оптическую активность протоплазмы, явилось, по Г. Ф. Гаузе, ароморфозом, обеспечившим повышение интенсивности химических процессов в организме. Д. И. Сапожников считает ароморфозом обогащение набора ферментов, вызванное ассимиляцией первичными существами органических веществ биогенного происхождения. Благовещенский обосновывает приложимость к биохимической эволюции понятия брадителической эволюции, введенного Дж. Симпсоном.
Становится все очевиднее, что представление о процессе эволюции должно охватывать не только морфологический, но и физиологический, биохимический и биофизический аспекты эволюции живого. Распространение исторического метода из области морфологии в области генетики, экологии, экспериментальной эмбриологии, гистологии, физиологии, биохимии, молекулярной биологии, а также синтез сравнительного, экспериментального и исторического методов составляют характерные черты развития биологии в XX в.
Опыт эволюционных направлений в перечисленных дисциплинах показывает, что познание эволюции данного объекта совершается тем успешнее, чем больше известно о закономерностях эволюции смежных уровней организации живого, смежных структур и процессов. Возникла новая закономерность развития эволюционной мысли — тенденция к сближению эволюционных направлений и синтезу их достижений. При обсуждении коренных вопросов теории эволюции фактический материал и обобщения эволюционных направлений не привлекались в должной мере. Это объясняется, по-видимому, тем, что опыт эволюционных направлений в частных биологических дисциплинах мало обобщен как исторически, так и теоретически.