Справедливость сказанного подтверждается опытом создания ряда частных эволюционных программ, значение которых в истории эволюционной мысли не подлежит сомнению.
Так, в гистологии появление эволюционной программы положило начало систематическому изучению путей и закономерностей эволюции тканей. Попытка уложить данные о гистологических структурах в существующие эволюционно-морфологические и филогенетические представления столкнулась с серьезными методологическими затруднениями. А. А. Заварзин наметил и осуществил широкую программу сравнительно-гистологических исследований, создав в итоге теорию эволюционной динамики тканей.
Она предполагала изучение последовательных этапов филогенеза тканей; выяснение потенциального резерва эволюционных возможностей тканей и путей проявления этих тенденций в гистогенезе, а также исследование своеобразия эволюции тканей в пределах целостной организации организма и вида. Для достижения поставленной цели Заварзин предложил оригинальный сравнительно-гистологический метод, основанный на принципе аналогии и системном подходе, а также широко использовал эксперимент. Школа Заварзина показала, что эволюция тканей обнаруживает известную специфику и может быть до конца понята только в пределах эволюции онтогенеза и вида, с учетом закономерностей молекулярно-биохимической организации.
Другая эволюционно-гистологическая программа была осуществлена Н. Г. Хлопиным и его школой. Целью ее было построение естественной системы тканей. Хлопин не только создал такую систему, но и предложил теорию дивергентной эволюции тканей. Исследования двух названных гистологических школ привели к созданию фундамента эволюционной гистологии.
В физиологии животных Л. А. Орбели, опираясь на идеи И. М. Сеченова, И. П. Павлова и Н. Е. Введенского, создал широкую эволюционную программу, которая объединила усилия физиологов, морфологов, биохимиков, клиницистов в единый коллектив, решающий одну общую задачу. Эволюционная физиология должна основываться, по мысли Орбели, на использовании данных сравнительной физиологии, омбриофизиологии, экспериментальной физиологии и клиники. Только применение такого комплекса позволяет решать главные задачи эволюционной физиологии — изучать историю формирования функций, каждой в отдельности и их взаимной связи, а также функциональную эволюцию с тем, чтобы понять, какова основная линия эволюционного процесса с точки зрения эволюции функций.