Важным направлением в изучении закономерностей эволюции биосферы стали исследования, посвященные преобразованию процессов литогенеза, а также общих путей и способов миграции элементов в литосфере.
Мысль об эволюции биогенного осадкообразования была впервые высказана в 1893 г. И. Вальтером, который считал, что «между морфологической формой и ее литогенетической деятельностью, между формой и образом жизни организмов существуют постоянные связи, что каждое изменение видового признака влечет за собой эволюцию литогенетических процессов» (Walther, 1893—1894, S. 1004). Эта мысль далеко не сразу получила должное развитие за рубежом. Между тем уже в 30—40-х годах она стала теоретической основой большинства отечественных исследований по эволюции литогенеза. Это объясняется укоренившейся в нашей стране еще с конца прошлого века биохимической концепцией аутигенного осадкообразования (Н. И. Андрусов, М. А. Егунов, Г. А. Надсон, Н. А. Соколов), а также революционизирующим влиянием биогеохимических работ Вернадского и Самойлова. Одна из задач палеобиохимии, по мнению Самойлова, заключалась в познании закономерностей эволюции литогенеза и минералообразования в связи с эволюцией живого.
Доказательства ведущей роли организмов и продуктов их жизнедеятельности в эволюции геологических и геохимических процессов приводились в работах Л. С. Берга, Н. Б. Вассоевича, А. П. Виноградова, А. Г. Вологдина, Ю. А. Жемчужникова, М. Д. Залесского, С. И. Кузнецова, Б. Л. Личкова, Д. В. Наливкина, Б. В. Перфильева, А. Б. Ронова, А. А. Саукова, Н. М. Страхова, В. О. Таусона, А. И. Тугаринова, М. С. Швецова и других исследователей, опубликованных в 40—70-х годах (см. подробнее: Лапо, 1979). Было продемонстрировано влияние живого на изменение темпов литогенеза, минералогического и химического состава осадочных пород, закономерностей их географического распространения и т. д.
Важным событием в разработке проблемы воздействия эволюции органического мира на геологические процессы стала V сессия Всесоюзного палеонтологического общества, состоявшаяся в 1959 г. Ее материалы опубликованы в книге «Значение биосферы в геологических процессах. Вопросы взаимосвязи палеонтологии и тектоники» (1962). На этой сессии, наряду с палеонтологами, зоологами, ботаниками, участвовали также и геологи — ведущие специалисты по полезным ископаемым осадочного происхождения. В многочисленных докладах была рассмотрена роль живого вещества в формировании земной коры в целом, в образовании карбонатных пород, каустобиолитов, железных и марганцевых руд и т. д. Как подчеркивалось в программном докладе сессии, сделанном Б. П. Марковским, необходимо «рассматривать развитие жизни на Земле, как одну из сторон развития Земли» (1962, с. 10). Проблемы эволюции биосферы были центральными и на XXV сессии Всесоюзного палеонтологического общества (Палеонтология и эволюция биосферы, 1979).