Вместе с тем имеются безусловные аналогии между филоценогенезом и филогенезом.
Так же как в таксономическом составе органического мира и в морфологии его представителей выявляются свидетельства прошлой истории, ранних этапов филогенеза, в структуре современных сообществ можно обнаружить черты архаичности, свойственные ранним этапам развития биосферы. В этом плане интересны ценозы, формирующиеся в экстремальных условиях, например в полярных пустынях. Филоценогенез сообществ полярных пустынь можно охарактеризовать как некую инверсию водного сообщества на сушу.
Их основу составляют исконно водные группы организмов. Основными продуцентами и главными эдификаторами являются одноклеточные водоросли, размножающиеся в огромном количестве на поверхности почвы и образующие вместе с лишайниками, в том числе и с их наиболее примитивными группами, сплошные корки на поверхности оголенных грунтов. Потребители первичной продукции — это также в основном исконно или вторично водные формы, такие как нематоды, малощетинковые черви, личинки комаров звонцов, тихоходки, влаголюбивые формы ногохвосток (Матвеева, Чернов, 1976). Сообщество полярной пустыни по существу представляет собой пионерную стадию сукцессии и одновременно отражает в своей структуре ранний этап развития жизни на Земле.
Еще один важный момент в развитии представлений об историческом преобразовании сообществ состоит в том, что масштабы исторического преобразования сообществ и эволюции организмов (т. е. масштабы изменений, происходящих в процессе конкретных филогенезов) совершенно несравнимы. Принципиальные особенности структуры сообществ, например главные механизмы круговорота веществ, основные его функциональные блоки (автотрофы, хищники, сапротрофы) сформировались уже на самом раннем этапе развития жизни на Земле (Гиляров, 1973). Эти блоки были свойственны уже примитивным псилофитовым сообществам (Плотников, 1979). В самых древних лесах были хорошо выражены не только основные функциональные звенья вполне зрелого сообщества, но и важнейшие морфологические части, свойственные и современным лесам: подстилка, травяноподобный ярус, несколько древесных пологов и т. д.