В 20—30-х годах Сукачев использовал понятие филогенеза применительно к динамике растительности и даже считал возможным проводить аналогию между историческим становлением ассоциаций и филогенезом видов.
Так, в своем широко известном труде «Растительные сообщества» он писал: «... мы можем говорить о филогении елового леса или его ассоциаций, имея в виду тот путь, какой прошел еловый лес, постепенно вырабатываясь в течение многих тысячелетий. В данном случае филогения ассоциаций будет соответствовать филогении вида» (цит. по: Сукачев, 1975, с. 256).
Однако в более поздних работах, посвященных временным сменам, понятие филогенеза он не употреблял, а ввел для обозначения процесса преобразования сообществ термин «филоценогенез» (Сукачев, 1942), что свидетельствует о стремлении отграничить это явление от понятия собственно биологической эволюции. В дальнейшем Сукачев (1952) подчеркивал, что развитие растительного покрова, т. е. филоценогенез, с одной стороны, и формирование флоры как результат видообразования, с другой, «несмотря на наличие известной связи между ними, — процессы совершенно различные, подчиняющиеся своим особым закономерностям».
Таким образом, выявились принципиальные различия между временным преобразованием сообществ и эволюционным процессом.
В этом плане особенно важно отметить полифилетичность и обратимость процессов преобразования сообществ. Приведем высказывание по этому поводу Ярошенко: «...лишь в сравнительно редких случаях можно допустить, что какой-либо тип растительности является в полном смысле слова эволюционным предшественником, или "предком", другого типа растительности... но зато не вызывают сомнения факты другой категории, когда одна крупная единица растительного покрова имеет не один, а несколько исходных типов, принявших участие в ее эволюционной выработке» (1961, с. 229). И далее: «...есть основание полагать, что и многие другие типы растительности также имеют не один, а несколько типов "сообществ-предков".
Называть эти последние предками можно, однако, лишь в переносном значении этого слова. Если какой-либо эволюционно более молодой тип растительности имеет несколько таких „предков", то это может означать, что он впервые возник в местах их взаимного контакта, причем каждый из них вложил свою долю в образование этого молодого типа. Такие исходные сообщества нужно называть не предками, а вкладчиками или участниками».