Полифилия (Haeckel, 1868) — происхождение таксона от более чем одного предка; сборное понятие, объединяющее четыре варианта:
а) ортополифилия, или концепция абсолютного параллелизма — эволюция органического мира множеством параллельных линий, берущих начало от первичных организмов, проходящих одинаковые стадии филогенетического развития;
б) конвергентная полифилия (Татаринов, 1976) — образование таксона в результате конвергенции;
в) гибридогенная полифилия — происхождение таксона в результате гибридизации;
г) симбиогенная полифилия — образование таксона путем симбиоза.
Как мы видели, на протяжении всей своей истории проблема моно- и полифилии постоянно была предметом оживленных дискуссий между сторонниками самых разных эволюционных течений, и в наше время не достигнуто единого понимания этой проблемы. Довольно часто дарвинисты утверждали, что признание полифилии — это проявление или уступка антидарвинизму. Антидарвинисты в свою очередь заявляли, что отход от монофилии — это свидетельство краха дарвинизма. Следует, однако, отметить, что это — явно полемическое преувеличение важности проблемы, так как ключевой характеристикой этих альтернативных направлений эволюционизма является признание или отрицание роли естественного отбора в эволюции.
Решение проблемы: моно- или полифилия — непосредственно не связано с признанием естественного отбора главной движущей силой эволюции. Поэтому нет однозначной корреляции между признанием моно- или полифилии и принадлежностью к тому или иному эволюционному лагерю. «Зачатки» полифилетизма можно обнаружить в воззрениях Дарвина и Геккеля. Концепцию строгой монофилии поддерживали не только убежденные дарвинисты, но и их противники, в частности Абель (Abel, 1909, 1929) — известный приверженец «закона биологической инерции». Полифилию признавали не только многие антидарвинисты, но и сторонники дарвинизма, например Холодковский (1888), и практически в виде концепции «широкой монофилии» признают такие крупнейшие представители современной синтетической теории эволюции, как Симпсон и Майр.