Помимо традиционного понимания проблемы моно- и полифилии в связи с дивергенцией, параллелизмами и конвергенцией, имеются и два других аспекта, являющихся следствием теорий, признающих симбиоз и гибридизацию в качестве факторов эволюции.
Рассмотрению роли симбиоза в эволюции в 20—40-е годы был посвящен ряд работ, авторы которых в отличие от Фаминцына и Мережковского (см. гл. 29) не противопоставляли его дарвиновской теории эволюции. «Теория симбиогенеза представляет как бы новую редакцию дарвинизма и, вероятно, будет иметь право называть себя неодарвинизмом» (Козо-Полянский, 1921, с. 24). Родословное дерево «...выражается не только расхождением линий, но и схождением, слиянием или сращением их: две и т. д. ветви, срастаясь, дают суммарное продолжение, которое в свою очередь может подвергнуться слиянию с иными ветвями и дать новую ветвь высшего порядка и т. д.» (1924, с. 128). Путем формативного симбиоза могут возникать самые различные таксоны, вплоть до типа и даже царства (1921, с. 7, 22). Однако теория симбиогенеза в ее обновленном варианте не встретила широкой поддержки и была подвергнута критике эволюционистами разных направлений.
В последнее десятилетие благодаря исследованиям в области изучения клетки вновь оживился интерес к этой теории. Сторонники ее, опираясь па новые данные, объясняют происхождение первичных эукариотных организмов путем последовательного эндосимбиоза. Результатом последнего «акта» симбиотической эволюции явилось образование растительных существ (Margulis, 1970, 1975; Тахтаджян, 1973). Как и у лишайников, рассматриваемых обычно на правах отдела или класса растений, признание симбиогенной организации Eucaryota означает полифилетическое происхождение ряда высших таксонов органического мира, так как вследствие симбиоза взаимоотношения между ними принимают характер сложной сети.
Развитие генетики стимулировало интерес к роли гибридизации в эволюции. Благодаря совместным усилиям генетиков, экологов и систематиков в 20—30-х годах ботаники вернулись к более обобщенному, хотя и разному, пониманию вида (новым «линнеонам»). Это был принципиально важный шаг для повой оценки гибридизации как фактора видообразования.