Своеобразие эволюции онтогенеза насекомых Ю. А. Захваткин (1974) связал со сложностью структуры их яйцеклеток, неприложимостью обычных критериев полярности к яйцам насекомых, своеобразием их развития, сложными «морфогенетическими движениями» и с процессом перемещения морфогенетически активной плазмы в яйце.
На материале по ресничным червям С. И. Богомолов (1961) обосновал положение о сопряженности изменений женских гонад, преобразований организации яйца и преобразований типа эмбрионального развития. Главную роль в эволюции гонад и онтогенеза у ресничных червей он отвел количеству желтка в ооцитах и условиям питания зародыша желточными клетками, обусловливающим исчезновение трохофорной личинки.
Важный этап в эволюции онтогенеза представляет появление первых наземных позвоночных — рептилий. Изучив происхождение эмбриональных приспособлений первых амниот, А. М. Сергеев (1943) предложил гипотезу, объяснявшую эволюционное возникновение эмбриональных приспособлений амниот. По Сергееву, яйца древних амфибий — стегоцефалов — развивались непрямым путем. Переход к прямому развитию рептилий сопровождался выпадением личиночной стадии, что повлекло за собой обеспечение зародыша дополнительными питательными веществами. У Squamata и Rhynchocephalia появились яйца, лишенные известковой и белковой оболочек.
Следующим этапом стало появление яиц с обеими названными оболочками. Клейдоичность яиц, т. е. снабженность их всеми необходимыми веществами, возросла. Стремясь заполнить пробел между анамниами и амниотами, Сергеев обратился к материалу по развитию амниона у беспозвоночных. Причину эволюции эмбриональных приспособлений амниот он усматривал в условиях существования личинок амфибий в обстановке кислородного режима мелких заболоченных водоемов каменноугольного периода и обострения борьбы за существование в них. Первый шаг в сторону адаптации к наземному развитию состоял в откладке яиц на суше с последующим возвращением личинки в воду. При этом увеличение количества желтка в яйце вызвало преобразование эмбрионального развития: возникло дискоидальное дробление, изменился процесс гаструляции. Эволюция яйца повлекла за собой коррелятивное изменение взрослых форм.