Среди закономерностей эволюции онтогенеза у растений выделяются ускорение первых этапов онтогенеза и их редукция (аббревиация), сопровождающиеся эмбрионизацией индивидуального развития (Мейер. 1958; Хохряков, 1981), тератогенез (Федоров, 1958), недоразвитие зародыша (Грушвицкий, 1961), сокращение длительности онтогенеза в целом и отдельных его циклов (Хохряков, 1973).
Проанализировано значение эмбриогенеза для филогении растений (М. С. Яковлев, 1960). Рассмотрены направления эволюции жизненных форм у покрытосеменных (Серебряков И. Г., 1955; Поддубная-Арнольдй, 1964). На основании изучения морфогенеза побегов прослежена эволюция жизненных форм злаков (Серебрякова, 1971). Детально изучена эволюция онтогенеза у паразитных цветковых растений и обсужден вопрос о ярко выраженной общности способов, механизмов и факторов эволюционно-морфологических преобразований у многоклеточных растений и животных и различиях в направлениях частных и общих преобразований (Терехин, 1977). Создана целостная картина эволюции онтогенеза растений (Скрипчинский, 1977). Утверждение в ботанике теории филэмбриогенеза привело к дальнейшему сближению эволюционной морфологии растений и животных.
Теория филэмбриогенеза получила признание. Она остается наиболее глубокой морфологической теорией соотношения онтогенеза и филогенеза. Северцов совершенствовал ее на протяжении трех десятилетий. Созданная первоначально на материале морфологии позвоночных теория в дальнейшем была проверена и уточнена на других объектах — беспозвоночных, растениях — и использована в качестве метода исследования при изучении эволюции тканей (Мирзоян, 1980). Сам Северцов рассматривал теорию филэмбриогенеза как первое приближение к более полной теории способов филогенетического преобразования органов, как основу, опираясь на которую экологи, генетики и механики развития, используя свой материал, создадут более полную модель эволюционного процесса.
И хотя Северцов, говоря о новой, более полной теории эволюции, имел в виду теорию соотношения онтогенеза и филогенеза, есть все основания утверждать, что его уверенность в плодотворности синтеза материала и обобщений из области эволюционной морфологии, экологии, генетики и механики развития должна быть распространена на всю его концепцию морфологических закономерностей эволюции. В реальной истории синтез, о котором говорил Северцов, действительно охватил все основные части его учения практически одновременно. Пути сближения искали как морфологи-эволюционисты, так и генетики и представители экспериментальной эмбриологии. Эти поиски были начаты в 20—30-е годы XX в., а в конце 30-х годов И. И. Шмальгаузен, опираясь на теорию макроэволюции, осуществил новый эволюционный синтез.