Другой путь анализа генетической структуры вида связан с изучением дифференциации пород домашних животных.
Он был избран А. С. Серебровским, который в 1926—1930 гг. предпринял ряд экспедиций на Кавказ с целью исследования местных популяций кур, разводимых в условиях сложного с географической и этнографической точки зрения района. На основе учета ряда наследственно детерминированных признаков экстерьера была показана высокая степень генетической дифференциации местных популяций кур и выявлена связь наблюдаемого распределения генов с историей формирования видового ареала (Серебровский, 1927 н др.). Им было выделено два различных способа распространения генов в ареале — путем «диффузии» и с помощью «генных потоков», введено понятие генофонда популяции и концентрации гена в генофонде.
Он сформулировал теоретические представления о геногеографии как самостоятельном пути изучения генетической структуры вида. Основная цель геногеографии — восстановление истории формирования популяций на основе изучения современного распределения генов в генофондах и процессов их распространения. Геногеографический подход позволял наиболее полно представить разнообразие видового генофонда и оценить возможности его хозяйственного использования. Геногеографический метод исследования лежал в основе работ по изучению пород домашних животных в Средней Азии, предпринятых с 1927 г. по инициативе Филипченко.
Был организован ряд комплексных экспедиций, в которых принимали участие Ф. Г. Добржанский, А. И. Зуйтин, Ю. Я. Керкис, М. Е. Лобашев, Я. Я. Лусис (Лус) и др. Полученные результаты имели большое значение как для практической селекционной работы, так и в теоретическом плане, способствуя развитию представлений о происхождений местных пород и о формах внутривидовой дифференциации, они формировали эволюционные взгляды самих исследователей.
Значительное влияние на развитие взглядов о генетической структуре вида имели исследования, проводившиеся Н. И. Вавиловым с сотрудниками на культурных растениях. В результате этих работ формировались и углублялись общебиологические представления о виде как сложной, иерархически организованной системе внутривидовых единиц.